如果崔浩等人和太武帝的禁佛就此停止，也许还有其可原谅的理由，崔浩本人也不至于遭到满门抄斩之祸，可惜此时的君臣谁也没有顾及这些，他们依旧沿着这条道路疯狂地向前急驰——中国历史上第一次佛门大劫难到来了。
太平真君六年（445年）九月，驻守在杏城（今陕西黄陵县）的将军盖吴谋反，关中狼烟顿起，一片混乱。翌年三月，太武帝亲率大军前往镇压。当他进入长安时，因军队暂时休整，马丁便将其坐骑牵到一座寺院的麦田里放牧。当太武帝为看马而来到寺院时，却发现和尚们正在请随从官员喝酒。对于官员与寺院僧众的异常亲热的举动，太武帝觉得有些蹊跷，急忙派人查验僧众的住室，发现了大批的弓矢矛盾等兵器。太武帝先是大惊，接着是大怒，愤然吼道：“这些兵器本非沙门所用，难道他们要与盖吴合谋反叛吗？”遂责令官兵彻底清查这座寺院。这一清查，寺院内许多不为人知的秘密暴露出来。先是查得大量酿酒用具，以及州县地方长官和富豪寄托或隐匿的财物，其数量竟达数万之多；后是发现了寺内的密室，这些密室多为“与贵室女私行淫乱”之用。当这一切全部暴露后，太武帝已是愤怒至极，而当时随从身边的崔浩立即感到这是消灭佛教的天赐良机，便趁机鼓动太武帝立即荡灭佛教，以绝后患。于是太武帝当即下诏：“诛杀长安城内的沙门，毁弃佛像。”并令太子拓跋晃行令天下四方，一体推行毁佛措施。