1873年,英印政府再次派福西特率领一支300人组成的特派使团,随同的还有6746名伕役和1620匹马,并带有维多利亚女王的亲笔信,于12月4日到达喀什噶尔。阿古柏向该使团表示:“我特别希望获得英国人的友谊,这对我是不可缺少的。”次年2月2日,福西特和阿古柏签订通商条约十二条。英国承认阿古伯为“艾米尔”(统治者),双方可以互派大使及商务专员;英人可以随意进入新疆,自由输入商品,只缴纳2.5%的从价税;可以在新疆境内购买、出售或租用土地、房屋和仓库。福西特使团还详细调查了新疆的历史、地理、气象、经济、政治各方面的情况,回印度后,写成600多页的报告书。在拉拢阿古柏以控制新疆南部的争夺中,英国取得了相对的优势地位。
俄国为了防止阿古柏建立亲英的统治,在与阿古柏正式签订通商条约之前,便于1871年出动大批军队,侵犯伊犁地区。
伊犁地区是由伊犁河上游及其三大支流特克斯河、巩乃斯河(空格斯河)和喀什河(哈什河)流域构成的,是中国西部边疆的战略要地,也是新疆最富庶的地区之一。当新疆发生各族民众的反清起事之时,俄国就计划出兵“对东干地区的两个主要中心——伊犁和乌鲁木齐实行军事占领”。1869年秋,阿古伯攻占库尔勒后,开始进犯北疆。俄国政府唯恐阿古柏攻占伊犁,于1870年8月命令七河省省长科尔帕科夫斯基派兵强占了伊犁通往南疆的咽喉要地穆索尔山口,并修筑通向伊犁的道路,开始集结部队,准备侵占伊犁。